Structural and functional characterization of Apoptin and design of a monomeric variant with antitumor activity

Author

Ruiz Martínez, Santiago

Director

Ribó i Panosa, Marc

Benito i Mundet, Antoni

Date of defense

2016-07-08

Pages

173 p.



Department/Institute

Universitat de Girona. Departament de Biologia

Abstract

The main aim of the present study is to characterize the biological and biophysical properties of Apoptin, a viral protein that selectively induces apoptosis of a wide range of tumor cells. Apoptin has been produced and purified fused to an N-terminal His-tag (H6-Apoptin). Two truncated variants of Apoptin, the first one lacking residues 1 to 27 (H6-ApopΔPro) and the second one lacking residues 1 to 43 (H6-ApopΔProΔLeu) were also produced. The second variant loses the aggregation tendency but maintains most of its biological properties (i.e. subcellular localization, DNA binding, antitumor activity when transfected into the cells). In contrast to Apoptin, this variant induces apoptosis in different tumor cells without affecting normal cells when it is added exogenously. The non-multimeric state of this variant has facilitated its structural characterization using NMR spectroscopy. This protein has been classified as an Intrinsically Disordered Protein (IDP).


En el presente estudio se caracterizan las propiedades biológicas y biofísicas de la Apoptina, una proteína vírica que induce apoptosis selectivamente sobre un gran rango de células tumorales. La Apoptina ha sido producida y purificada fusionada a un His-tag N-termnial (H6-Apoptina). Se ha producido una primera variante eliminando los primeros 27 residuos (H6-ApoΔPro) y una segunda sin los 43 primeros residuos (H6-ApopΔProΔLeu). La segunda de las variantes pierde la tendencia a la agregación pero mantiene la mayoría de propiedades biológicas (localización subcelular, unión a DNA y actividad antitumoral en células transfectadas con el gen. A diferencia de la Apoptina, esta variante induce apoptosis en diferentes líneas tumorales sin afectar las células normales cuando se añade exógenamente. El estado no multimérico de esta variante ha facilitado su caracterización estructural utilizando la espectroscopia de RMN. Dicha proteína ha sido clasificada como Proteína Intrínsecamente Desordenada (IDP).

Keywords

Apoptin; Apoptina; Apoptosi; Apoptosis; Protein engineering; Enginyeria de proteïnes; Ingeniería de proteínas; Anticancer drugs; Medicaments anticancerosos; Fármacos anticancerosos; IDP; Intrinsically Disordered Protein; Proteïna Intrínsicament Desordenada; Proteína intrínsicamente Desordenada

Subjects

577 - Material bases of life. Biochemistry. Molecular biology. Biophysics; 616 - Pathology. Clinical medicine

Documents

tsrm1de1.pdf

5.592Mb

 

Rights

ADVERTIMENT. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.

This item appears in the following Collection(s)